Pengembangan ilmu pengetahuan dan perluasan wawasan memerlukan wadah aspirasi dan ruang diskusi akademik yang luas. Kegiatan konferensi ilmiah diselenggarakan oleh UIN Walisongo sebagai jembatan untuk mempertemukan berbagai gagasan dan pengetahuan lintas bidang ilmu.
Universitas Islam Indonesia telah menyelenggarakan berbagai kegiatan konferensi ilmiah baik di tingkat nasional maupun internasional yang mengundang komunitas akademik secara luas untuk berbagi gagasan dan mempresentasikan hasil penelitian terkini yang mereka lakukan. Beberapa agenda konferensi di UIN Walisongo bahkan telah dilaksanakan sebagai agenda dan menjadi program unggulan.
Portal Jurnal UIN Walisongo adalah sistem manajemen jurnal elektronik yang dipublikasikan oleh UIN Walisongo. Dikelola berdasarkan Sistem Akreditasi Jurnal Kemristekdikti ARJUNA dan menjadi bagian dari Sitasi Jurnal dari Indonesian Science Index (SINTA). UIN Walisongo sebagai penerbit jurnal daring (online) telah menjadi anggota DOAJ (Directory of Open Access Journals) dan terindeks di BASE (Bielefeld Academic Search Engine).